• Ez az e-mail-cím a szpemrobotok elleni védelem alatt áll. Megtekintéséhez engedélyeznie kell a JavaScript használatát.

Tevékenység és infrastruktúra

HPC (HP Cluster)

Természettudományi központ | Komplex Molekuláris Rendszerek Kutatócsoport
Kutatási terület: Molekuláris modellezés, számítógépes szimuláció, molekuláris dinamika, Monte Carlo

High-Performance Computing erőforrás. Párhuzamos (mpi, openMP) számításokra is alkalmas clusterszámítógép (számítógépfürt): 16 worker node, 268 processzormaggal, nodeonként 4-64 GB memóriával. A  többfeladatos kötegelt futtatásokhoz TORQUE erőforrás-kezelő és Maui feladatütemező áll rendelkezésre, Ubuntu szerver operációsrendszerrel. Előre telepített programkódok és saját programok is futtathatók rajta.   


Gromacs

Természettudományi központ | Komplex Molekuláris Rendszerek Kutatócsoport
Kutatási terület: Molekuláris modellezés, számítógépes szimuláció, molekuláris dinamika, Monte Carlo

Ingyenes és nyílt forráskódú, párhuzamosított szoftvercsomag nagy teljesítményű molekuladinamikai szimulációkhoz és különböző molekuláris szimulációs elemzésekhez. Többféle szimulációs eljárást kínál, melyekhez előkészítő és elemző eszközök is bőségesen rendelkezésre állnak a programcsomagban.


LAMMPS

Természettudományi központ | Komplex Molekuláris Rendszerek Kutatócsoport
Kutatási terület: Molekuláris modellezés, számítógépes szimuláció, molekuláris dinamika, Monte Carlo

A LAMMPS egy klasszikus molekuladinamikai szoftver, amelynek fő felhasználási területe az anyagtudományi modellezés. A LAMMPS a szilárd anyagok (fémek, félvezetők) és a lágy anyagok (biomolekulák, polimerek), valamint a durva szemcsés vagy mezoszkopikus rendszerek esetén is kínál lehetőségeket, molekuláris szimulációk elvégzésére. Használható atomi szintű modellezésére, vagy általánosabban párhuzamos részecskeszimulátorként atomi, mezo- vagy kontinuum léptékben.